RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDDC3-202ENST00000394272 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.66■■□□□ 1.38
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HDDC3-202ENST00000394272 H3BQV1 296 aa23.64■■□□□ 1.38
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HDDC3-202ENST00000394272 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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HDDC3-202ENST00000394272 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D12O60347 775 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 TNFAIP1Q13829 316 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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HDDC3-202ENST00000394272 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.56■■□□□ 1.36
HDDC3-202ENST00000394272 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
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