RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.25■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 GUCY1A2P33402 732 aa27.24■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 NOVP48745 357 aa27.24■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 TMEM47Q9BQJ4 181 aa27.24■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.24■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.23■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 IQCA1LA6NCM1 817 aa27.22■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 ADM5C9JUS6 153 aa27.22■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 PHF20L1A8MW92 1017 aa27.22■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 POTEJP0CG39 1038 aa27.22■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.22■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.22■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.22■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 KAT14Q9H8E8 782 aa27.22■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.21■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.21■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 PNMA1Q8ND90 353 aa27.21■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
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CNN3-202ENST00000394202 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 RASGRP2Q7LDG7 609 aa27.2■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 FANCBQ8NB91 859 aa27.2■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.2■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.2■■□□□ 1.95
CNN3-202ENST00000394202 GJB2P29033 226 aa27.2■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 RRAGCQ9HB90 399 aa27.2■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 MTMR7Q9Y216 660 aa27.2■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.19■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.19■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.19■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 SULF1Q8IWU6 871 aa27.19■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 DDX11Q96FC9 970 aa27.18■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.18■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.18■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 TTLL1O95922 423 aa27.18■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 CAP2P40123 477 aa27.18■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.18■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 NID2Q14112 1375 aa27.18■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 DDAH1O94760 285 aa27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 USP48Q86UV5 1035 aa27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 PTPDC1A2A3K4 754 aa27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 RCAN1P53805 252 aa27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.17■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 CABP5Q9NP86 173 aa27.16■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 CPLX1O14810 134 aa27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 INPP5BP32019 993 aa27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 ICA1Q05084 483 aa27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 PHKBQ93100 1093 aa27.15■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.14■■□□□ 1.94
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CNN3-202ENST00000394202 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.14■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 NMRK2Q9NPI5 230 aa27.14■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 NYAP2Q9P242 653 aa27.14■■□□□ 1.94
CNN3-202ENST00000394202 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.13■■□□□ 1.93
CNN3-202ENST00000394202 CALM1P0DP23 149 aa27.13■■□□□ 1.93
CNN3-202ENST00000394202 CALM2P0DP24 149 aa27.13■■□□□ 1.93
CNN3-202ENST00000394202 CALM3P0DP25 149 aa27.13■■□□□ 1.93
CNN3-202ENST00000394202 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PRG0 241 aa27.13■■□□□ 1.93
CNN3-202ENST00000394202 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa27.13■■□□□ 1.93
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CNN3-202ENST00000394202 MKL1Q969V6 931 aa27.13■■□□□ 1.93
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