RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 BMP15O95972 392 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 CFBP00751 764 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 TECP42680 631 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SNAP25P60880 206 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SPA17Q15506 151 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC174Q6PII3 467 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 CENPHQ9H3R5 247 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.79■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 KCTD1Q719H9 257 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 TEKT1Q969V4 418 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 CSRNP2Q9H175 543 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 PDE4DQ08499 809 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 GPS2Q13227 327 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 ATL3Q6DD88 541 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SCG2P13521 617 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 HSPA1LP34931 641 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 ARID5BQ14865 1188 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SALL3Q9BXA9 1300 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 EPSTI1Q96J88 318 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.78■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 AKR1B10O60218 316 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 COA7Q96BR5 231 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 MXD3Q9BW11 206 aa16.77■□□□□ 0.28
ZBED1-202ENST00000381222 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 SORBS3O60504 671 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ATP2B4P23634 1241 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.275e-10■■■■■ 122.8
ZBED1-202ENST00000381222 BCS1LQ9Y276 419 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.77■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 CSF1RP07333 972 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NLRP12P59046 1061 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 UBXN2AP68543 259 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 BLIDQ8IZY5 108 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 RUFY1Q96T51 708 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ODF2Q5BJF6 829 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 SLC39A14Q15043 492 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.273e-6■■■■□ 20.4
ZBED1-202ENST00000381222 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.76■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 KIF28PB7ZC32 967 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 GRAPQ13588 217 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 KIFC2Q96AC6 838 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 LRWD1Q9UFC0 647 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ERICH4A6NGS2 130 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NEMFO60524 1076 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 CMA1P23946 247 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 GRM1Q13255 1194 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 TAF3Q5VWG9 929 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 DESI2Q9BSY9 194 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 USP32Q8NFA0 1604 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 FAM205CA6NFA0 338 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 JADE2Q9NQC1 790 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 RMND1Q9NWS8 449 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.75■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ATP1A3P13637 1013 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ALDH1B1P30837 517 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 AK9Q5TCS8 1911 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.74■□□□□ 0.27
ZBED1-202ENST00000381222 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms