RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 SHDQ96IW2 340 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CRBNQ96SW2 442 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF2CQ99661 725 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.426e-35■□□□□ 8.5
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS13O14921 159 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 FGRP09769 529 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH24Q86UP0 819 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.19□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF10CO14798 259 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 ACRP10323 421 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 RAG1P15918 1043 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC9A7Q96T83 725 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 UBOX5O94941 541 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 TGFB1P01137 390 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 GBP1P32455 592 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 TM9SF2Q99805 663 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 PIM2Q9P1W9 311 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCY2CP25092 1073 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 ETFBP38117 255 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 U3KQE9 123 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP26A1O43174 497 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 FOSL1P15407 271 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP7A1P22680 504 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNFP41002 786 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 ETV3P41162 512 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 OXCT1P55809 520 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 VWCEQ96DN2 955 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF112Q9ULX5 631 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1W2PQH9 124 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP2B1P20020 1258 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CASP7P55210 303 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 MCTP1Q6DN14 999 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC6Q86TZ1 520 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM192Q8IY95 271 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR33A8MZF0 331 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CBX7O95931 251 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF141Q8WVD5 230 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 COX4I2Q96KJ9 171 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A18Q96N87 628 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 COBLO75128 1261 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRN2O75325 713 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CLEC3AO75596 197 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 MED26O95402 600 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 GRIK1P39086 918 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-202ENST00000370826 CHMP4BP1P59074 171 aa6.12□□□□□ -1.43
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