RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 EVCP57679 992 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ATP2B2Q01814 1243 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MICU3Q86XE3 530 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 NECAB1Q8N987 351 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GTF3C6Q969F1 213 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RRAGCQ9HB90 399 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.24□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CDKL5O76039 1030 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 DDAH1O94760 285 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TTLL1O95922 423 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RCAN1P53805 252 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PPP2R5BQ15173 497 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 USP48Q86UV5 1035 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PNMA1Q8ND90 353 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CEP95Q96GE4 821 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TEPSINQ96N21 525 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 KIF3AQ9Y496 699 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 DOCK1Q14185 1865 aa14.23□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GH2P01242 217 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SLURP2P0DP57 97 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ICA1Q05084 483 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SCRN1Q12765 414 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RTN1Q16799 776 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ANKS1AQ92625 1134 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MYL10Q9BUA6 226 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SENP2Q9HC62 589 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.22□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ADM5C9JUS6 153 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RAD21O60216 631 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 ASNSP08243 561 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 RXRAP19793 462 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 KIF5BP33176 963 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CAP2P40123 477 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MAP3K10Q02779 954 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 SEPT2Q15019 361 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 GINM1Q9NU53 330 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 MTMR7Q9Y216 660 aa14.21□□□□□ -0.13
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 POTECB2RU33 542 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 FANCBQ8NB91 859 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 SH2D4AQ9H788 454 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 NYAP2Q9P242 653 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 GJB2P29033 226 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 GNAQP50148 359 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 PRKG1Q13976 671 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 LDHDQ86WU2 507 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 CDCA5Q96FF9 252 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 WRNIP1Q96S55 665 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 MAP3K14Q99558 947 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 PICK1Q9NRD5 415 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 NID2Q14112 1375 aa14.19□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 MYH6P13533 1939 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.18□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.17□□□□□ -0.14
PTPRK-201ENST00000368202 USP17L5A8MUK1 530 aa14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.6 ms