RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 Q96M66 194 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 GCM1Q9NP62 436 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 CYP7A1P22680 504 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF605Q86T29 641 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 PEX10O60683 326 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM13O60858 407 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 SEMA7AO75326 666 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 SYN1P17600 705 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 GRK4P32298 578 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 NFIXQ14938 502 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 LILRA2Q8N149 483 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD3Q9Y597 815 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 TREHO43280 583 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 SGPP1Q9BX95 441 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-202ENST00000367364 EGR3Q06889 387 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 SSPNQ14714 243 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 SETDB2Q96T68 719 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 GFRA2O00451 464 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 PLCB3Q01970 1234 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 NR0B2Q15466 257 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF385BQ569K4 471 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP13Q9UII6 198 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 FITM1A5D6W6 292 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 NFKB2Q00653 900 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 OXR1Q8N573 874 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 CXorf38Q8TB03 319 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 GGNQ86UU5 652 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 EBF1Q9UH73 591 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 ETV3P41162 512 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 FBF1Q8TES7 1133 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 SHISA4Q96DD7 197 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 PANK1Q8TE04 598 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM87BQ96K49 555 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-202ENST00000367364 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 RFXAPO00287 272 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PDE6BP35913 854 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 GALK1P51570 392 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PI3P19957 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SEPT6Q14141 434 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A19Q695T7 634 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SV2BQ7L1I2 683 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 GPR160Q9UJ42 338 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 GIPC1O14908 333 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PSPNO60542 156 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 PGRP06401 933 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L7P0C7H9 530 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 LTKP29376 864 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 EFEMP2O95967 443 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 SNX17Q15036 470 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf49Q9H741 205 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 NOTOA8MTQ0 251 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK8P45983 427 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-202ENST00000367364 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
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