RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 TPM3P06753 285 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PTPREP23469 700 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PLCD1P51178 756 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 NPY5RQ15761 445 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CNNM3Q8NE01 707 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TIGD1Q96MW7 591 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 SBK1Q52WX2 424 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PRR29P0C7W0 189 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 C12orf60Q5U649 245 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 BMP6P22004 513 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TERF1P54274 439 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CSRNP2Q9H175 543 aa25.91■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 ATP1A3P13637 1013 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CDC25BP30305 580 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PDE4BQ07343 736 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RASGRP2Q7LDG7 609 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CD209Q9NNX6 404 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 KRT2P35908 639 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 POLLQ9UGP5 575 aa25.9■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 LAMB1P07942 1786 aa25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 DDAH1O94760 285 aa25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PTPN21Q16825 1174 aa25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CRY2Q49AN0 593 aa25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TSC1Q92574 1164 aa25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 IFNKQ9P0W0 207 aa25.89■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 OLFM4Q6UX06 510 aa25.89■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.89■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF174Q15697 407 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 SMC2O95347 1197 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 PPP2R5BQ15173 497 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF827Q17R98 1081 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 PROM2Q8N271 834 aa25.88■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 A0A087X0B3 334 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 EPSTI1Q96J88 318 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 CALM1P0DP23 149 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 CALM2P0DP24 149 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 CALM3P0DP25 149 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 ST5P78524 1137 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 ADRA2BP18089 450 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 CERKQ8TCT0 537 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 GGA1Q9UJY5 639 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 XBP1P17861 261 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 BTDP43251 543 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 TNFRSF25Q93038 417 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.86■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 CASP1P29466 404 aa25.85■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM75PA6NK02 468 aa25.85■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.85■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 MAP7D2Q96T17 732 aa25.85■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 DPF2Q92785 391 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 CPVLQ9H3G5 476 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 KAT14Q9H8E8 782 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 PNMA1Q8ND90 353 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.84■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 USP27XA6NNY8 438 aa25.83■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 C6orf229H3BNL8 230 aa25.83■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 RIMBP2O15034 1052 aa25.83■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 SCG2P13521 617 aa25.83■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.83■■□□□ 1.73
C9orf163-201ENST00000354376 POSTNQ15063 836 aa25.83■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.83■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.83■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 BAG3O95817 575 aa25.82■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 NLRP5P59047 1200 aa25.82■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.82■■□□□ 1.72
C9orf163-201ENST00000354376 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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