RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 PTPN21Q16825 1174 aa20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RUBCNQ92622 972 aa20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 MYO6Q9UM54 1294 aa20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.6■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 TRIM75PA6NK02 468 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RXRAP19793 462 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 VSNL1P62760 191 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 SEMA3FQ13275 785 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF827Q17R98 1081 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 METTL24Q5JXM2 366 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 AIDAQ96BJ3 306 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 CSRNP2Q9H175 543 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 PSMD14O00487 310 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 CASP14P31944 242 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ARHGAP25P42331 645 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 PAGE5Q96GU1 130 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 SENP2Q9HC62 589 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.59■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 GRIN1Q05586 938 aa20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 NAPBQ9H115 298 aa20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.58■□□□□ 0.89
KRCC1-201ENST00000347055 RTL9Q8NET4 1388 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 ERICH2A1L162 156 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 SPECC1Q5M775 1068 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PPM1EQ8WY54 764 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 GYS2P54840 703 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 WTAPQ15007 396 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 YY1AP1Q9H869 796 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 RMND1Q9NWS8 449 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.57■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 MYH3P11055 1940 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 BCORQ6W2J9 1755 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 VGLL3A8MV65 326 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PPFIA4O75335 1185 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 CPP00450 1065 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 USP14P54578 494 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 CORO7P57737 925 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.56■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PI16Q6UXB8 463 aa20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC102AQ96A19 550 aa20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.55■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 A1BGP04217 495 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 ERVK-24P63145 666 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PQC6 194 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 N4BP3O15049 544 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 GUCY1A2P33402 732 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 KRT2P35908 639 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 MAP3K12Q12852 859 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 KRT31Q15323 416 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 IQCEQ6IPM2 695 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 MYL10Q9BUA6 226 aa20.54■□□□□ 0.88
KRCC1-201ENST00000347055 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms