RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329553.2

RIPPLY3-201, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RIPPLY3, Length 2,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-201ENST00000329553 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 PIM2Q9P1W9 311 aa23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 NFIAQ12857 509 aa23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 BRAPQ7Z569 592 aa23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 PGBD1Q96JS3 809 aa23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 KAT14Q9H8E8 782 aa23.48■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 GABPAQ06546 454 aa23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.47■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.46■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 PNMA1Q8ND90 353 aa23.46■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 PKN1Q16512 942 aa23.45■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.45■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RIPPLY3-201ENST00000329553 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CACNB3P54284 484 aa23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 STX8Q9UNK0 236 aa23.45■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYH6P13533 1939 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 OFD1O75665 1012 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 RNF214Q8ND24 703 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 RAD17O75943 681 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 LIG1P18858 919 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 COL4A5P29400 1685 aa23.44■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 MMP1P03956 469 aa23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SOGA3Q5TF21 947 aa23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CLIC4Q9Y696 253 aa23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAP3K14Q99558 947 aa23.43■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SHISA4Q96DD7 197 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 IDI2Q9BXS1 227 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 VPS33BQ9H267 617 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 PSME4Q14997 1843 aa23.42■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 PSMD14O00487 310 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 KIF5BP33176 963 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 TCP10Q12799 353 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CFAP100Q494V2 611 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CEP95Q96GE4 821 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 BTBD18B2RXH4 712 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.41■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 HLA-DOAP06340 250 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 GRM4Q14833 912 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SLURP2P0DP57 97 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 NOVP48745 357 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 KLHL34Q8N239 644 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 BICD2Q8TD16 824 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 GMLQ99445 158 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SWAP70Q9UH65 585 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 MTMR7Q9Y216 660 aa23.4■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 AKR1B1P15121 316 aa23.39■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 SHMT1P34896 483 aa23.39■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
RIPPLY3-201ENST00000329553 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 UVSSAQ2YD98 709 aa23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 ANO1Q5XXA6 986 aa23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.39■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 YEATS4O95619 227 aa23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 TPM2P07951 284 aa23.38■■□□□ 1.33
RIPPLY3-201ENST00000329553 STK38Q15208 465 aa23.38■■□□□ 1.33
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