RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 WASF1Q92558 559 aa25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTN1Q16799 776 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNGA4Q8IV77 575 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS16Q9H269 839 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PHKA1P46020 1223 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE3CQ15386 1083 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 SHISA4Q96DD7 197 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO6Q9UM54 1294 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ENC1O14682 589 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM71BQ8TC56 605 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 WNT7AO00755 349 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAPBQ9H115 298 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFR2Q9UP52 801 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIP4K2BP78356 416 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCIRG1Q13488 830 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBB2AQ13885 445 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT31Q15323 416 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CHP1Q99653 195 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 N4BP3O15049 544 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRKAB2O43741 272 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 AMPD2Q01433 879 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARMT1Q9H993 441 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPS6KA5O75582 802 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 GREM2Q9H772 168 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCC12Q96J65 1359 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO3Q9UK99 471 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MBD4O95243 580 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEXIO95424 95 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CSF1RP07333 972 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PACS2Q86VP3 889 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 EFCC1Q9HA90 598 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MST1RQ04912 1400 aa25.23■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF40O75150 1001 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGA6P23229 1130 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 GBP3Q9H0R5 595 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 STRCQ7RTU9 1775 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 FECHP22830 423 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.22■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 SRGAP2O75044 1071 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMYND10O75800 440 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 WTAPQ15007 396 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATRNO75882 1429 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRDM1O75626 825 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 KRT9P35527 623 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC51Q96ER9 411 aa25.21■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRIM75PA6NK02 468 aa25.2■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.2■■□□□ 1.63
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms