RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 APBA1Q02410 837 aa16.54■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.54■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.54■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.53■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM170AA1A519 330 aa16.53■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RPS6KA5O75582 802 aa16.52■□□□□ 0.24
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 SALL1Q9NSC2 1324 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT31Q15323 416 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 MICALCLQ6ZW33 695 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUBB2AQ13885 445 aa16.52■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEDD9Q14511 834 aa16.52■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.52■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.52■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 HPSEQ9Y251 543 aa16.52■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NNTQ13423 1086 aa16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PTPAQ15257 358 aa16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPA17Q15506 151 aa16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADORA1P30542 326 aa16.51■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF5AQ12840 1032 aa16.51■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF18P17022 549 aa16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAX7P23759 505 aa16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 IQCEQ6IPM2 695 aa16.51■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.51■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.5■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MED15Q96RN5 788 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 COPRSQ9NQ92 184 aa16.5■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM205CA6NFA0 338 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAFAH1B1P43034 410 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.5■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 MORC3Q14149 939 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 APOA5Q6Q788 366 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNPY4Q8N129 248 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 OXER1Q8TDS5 423 aa16.5■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNJ18B7U540 433 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRDM1O75626 825 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 KCNJ12Q14500 433 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.49■□□□□ 0.23
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 KRT26Q7Z3Y9 468 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR8K1Q8NGG5 319 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 TTC26A0AVF1 554 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 ELF1P32519 619 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF14Q5TI25 921 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 IQCA1Q86XH1 822 aa16.49■□□□□ 0.23
CCNDBP1-201ENST00000300213 NELFBQ8WX92 580 aa16.49■□□□□ 0.23
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