RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269844.4

PRDM15-201, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM15, Length 4,881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-201ENST00000269844 PSMD6Q15008 389 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 METTL24Q5JXM2 366 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CXorf38Q8TB03 319 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TXLNGQ9NUQ3 528 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CA8P35219 290 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 PCYT1AP49585 367 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SLF2Q8IX21 1173 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 RAB17Q9H0T7 212 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 A0A087WZG4 1122 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 EMBQ6PCB8 327 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CASP14P31944 242 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 NME8Q8N427 588 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TBC1D5Q92609 795 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 IKBKBO14920 756 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 NDUFA8P51970 172 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CETN1Q12798 172 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 VSTM4Q8IW00 320 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 PSMD7P51665 324 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 GMNCA6NCL1 334 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 KRT15P19012 456 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 DPH5Q9H2P9 285 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MCM7P33993 719 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 LRRC31Q6UY01 552 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 P3H4Q92791 437 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 HSPA1LP34931 641 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 KRT12Q99456 494 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 AP1G2O75843 785 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 PHEXP78562 749 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 VSNL1P62760 191 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 COG1Q8WTW3 980 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SATB2Q9UPW6 733 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TBC1D8O95759 1140 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 HOOK2Q96ED9 719 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SSH2Q76I76 1423 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 CFAP73A6NFT4 308 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 STOML1Q9UBI4 398 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MSH2P43246 934 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SLC7A5Q01650 507 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 DEUP1Q05D60 604 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF827Q17R98 1081 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 RNF217Q8TC41 542 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 MIEF2Q96C03 454 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 KCNK3O14649 394 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 IRAK1P51617 712 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 KRIT1O00522 736 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM15-201ENST00000269844 RAD23BP54727 409 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms