RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 IKBKGQ9Y6K9 419 aa26.81■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 COBLO75128 1261 aa26.81■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.81■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.81■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.8■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.8■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.8■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 USP6P35125 1406 aa26.8■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 KCNJ12Q14500 433 aa26.8■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.8■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.8■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 GSTA5Q7RTV2 222 aa26.79■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 ANKS4BQ8N8V4 417 aa26.79■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.79■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 RESTQ13127 1097 aa26.78■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 HINFPQ9BQA5 517 aa26.78■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.78■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 FAM170AA1A519 330 aa26.78■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 AIFM3Q96NN9 605 aa26.78■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 CEP104O60308 925 aa26.78■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC50Q8IVM0 306 aa26.78■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 ARID5BQ14865 1188 aa26.78■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 CNBD1Q8NA66 436 aa26.77■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 MSL1Q68DK7 614 aa26.77■■□□□ 1.88
CHSY1-201ENST00000254190 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.77■■□□□ 1.88
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CHSY1-201ENST00000254190 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.75■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 ASIC2Q16515 512 aa26.75■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 IFT20Q8IY31 132 aa26.75■■□□□ 1.87
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CHSY1-201ENST00000254190 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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CHSY1-201ENST00000254190 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 SMCO2A6NFE2 343 aa26.74■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
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CHSY1-201ENST00000254190 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa26.74■■□□□ 1.87
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CHSY1-201ENST00000254190 GPR108Q9NPR9 543 aa26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 ATP1A3P13637 1013 aa26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 PNMA1Q8ND90 353 aa26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 NCAPH2Q6IBW4 605 aa26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.73■■□□□ 1.87
CHSY1-201ENST00000254190 SPOPO43791 374 aa26.72■■□□□ 1.87
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