RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 EHD4Q9H223 541 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF6Q15052 776 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 FSD1Q9BTV5 496 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 ARMT1Q9H993 441 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 PRKAB2O43741 272 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 OSBPP22059 807 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 BACE1P56817 501 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 MTMR2Q13614 643 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 TICAM2Q86XR7 235 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF333Q96JL9 665 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 GH2P01242 217 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SHMT1P34896 483 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SMIM22K7EJ46 135 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 GABPAQ06546 454 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 TTC6Q86TZ1 520 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 FAM227BQ96M60 508 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SRRDQ9UH36 339 aa20.6■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 MBD4O95243 580 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 GNRH1P01148 92 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 CYP2D6P10635 497 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.59■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0D9SFI3 127 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 MCM2P49736 904 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 UBE3CQ15386 1083 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 KCNB2Q92953 911 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 GINM1Q9NU53 330 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.58■□□□□ 0.89
HOXC6-201ENST00000243108 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 GUCY1A2P33402 732 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 NEK4P51957 841 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PTH1RQ03431 593 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 GABRQQ9UN88 632 aa20.58■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 MYH8P13535 1937 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L10C9JJH3 530 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PEX10O60683 326 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PRKCZQ05513 592 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PRMT2P55345 433 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PNMA3Q9UL41 463 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 MYPNQ86TC9 1320 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 FCGRTP55899 365 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 MAP4K1Q92918 833 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 C19orf81C9J6K1 198 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 NECTIN1Q15223 517 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 ACER1Q8TDN7 264 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF11Q86T75 865 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 RASEFQ8IZ41 740 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 HOXD10P28358 340 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 MTFR1Q15390 333 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PLXNB2O15031 1838 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 SEPT2Q15019 361 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 RAET1EQ8TD07 263 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 GRK4P32298 578 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 FLT3LGP49771 235 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 C12orf60Q5U649 245 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms