RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.96■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 NECAB1Q8N987 351 aa26.96■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.96■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 MYL10Q9BUA6 226 aa26.96■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa26.96■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.95■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.95■■□□□ 1.91
USF2-201ENST00000222305 YY1P25490 414 aa26.95■■□□□ 1.91
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USF2-201ENST00000222305 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.95■■□□□ 1.91
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USF2-201ENST00000222305 TMTC2Q8N394 836 aa26.95■■□□□ 1.91
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USF2-201ENST00000222305 RXRAP19793 462 aa26.94■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.94■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 CAP2P40123 477 aa26.94■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 MICU3Q86XE3 530 aa26.94■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.94■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 CABP5Q9NP86 173 aa26.94■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.94■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.93■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.93■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.93■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.93■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 NOVP48745 357 aa26.92■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 KAT14Q9H8E8 782 aa26.92■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 ZBTB43O43298 467 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 PFKFB2O60825 505 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 INPP5BP32019 993 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 ATP2B2Q01814 1243 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 SCRN1Q12765 414 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 CUL4AQ13619 759 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 GTF3C6Q969F1 213 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 WRNIP1Q96S55 665 aa26.91■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.9■■□□□ 1.9
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USF2-201ENST00000222305 DTNBO60941 627 aa26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.9■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
USF2-201ENST00000222305 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.91e-6■■■□□ 16.3
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USF2-201ENST00000222305 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 KIF3CO14782 793 aa26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 NF2P35240 595 aa26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 MTMR7Q9Y216 660 aa26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 MYH6P13533 1939 aa26.88■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ASNSP08243 561 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 TROAPQ12815 778 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 TRPM7Q96QT4 1865 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 DDAH1O94760 285 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 NYAP2Q9P242 653 aa26.87■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 NID2Q14112 1375 aa26.86■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 CDC27P30260 824 aa26.86■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.86■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.892e-7■■□□□ 12
USF2-201ENST00000222305 MOB2Q70IA6 237 aa26.85■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 SCYL3Q8IZE3 742 aa26.85■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.85■■□□□ 1.89
USF2-201ENST00000222305 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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