RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A087X0B3 334 aa25.19■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 SHISA4Q96DD7 197 aa25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.19■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 SEC23AQ15436 765 aa25.18■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP2B1P20020 1258 aa25.18■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.18■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 DPYDQ12882 1025 aa25.17■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 FERMT2Q96AC1 680 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 EPSTI1Q96J88 318 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.17■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 XBP1P17861 261 aa25.16■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 PKN1Q16512 942 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.16■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 NUP98P52948 1817 aa25.16■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC51Q96ER9 411 aa25.16■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.16■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 CDC23Q9UJX2 597 aa25.15■■□□□ 1.62
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HTATSF1-201ENST00000218364 STX17P56962 302 aa25.13■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 MAP2K7O14733 419 aa25.13■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 ITGB4P16144 1822 aa25.13■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 POTEB2H3BUK9 544 aa25.11■■□□□ 1.61
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HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 GYPCP04921 128 aa25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 CASP1P29466 404 aa25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 CASP14P31944 242 aa25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0U1RQJ8 604 aa25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 USP5P45974 858 aa25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.1■■□□□ 1.61
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.1■■□□□ 1.61
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