RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.95■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 MED15Q96RN5 788 aa25.95■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 CTAGE9A4FU28 777 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 BTBD18B2RXH4 712 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 APPP05067 770 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RXRAP19793 462 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT23Q9C075 422 aa25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 L1RE1Q9UN81 338 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 MYH3P11055 1940 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 H3BQF6 201 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 PDE8AO60658 829 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 MFAP3LO75121 409 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 DEXIO95424 95 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 METTL24Q5JXM2 366 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RAD9BQ6WBX8 426 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 SENP2Q9HC62 589 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 LEKR1Q6ZMV7 388 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 TMTC2Q8N394 836 aa25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RBL2Q08999 1139 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ITPK1Q13572 414 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 MTF1Q14872 753 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 PI16Q6UXB8 463 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 GSDMAQ96QA5 445 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RASSF4Q9H2L5 321 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.91■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 LMAN1P49257 510 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 CUL4BQ13620 913 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 SPECC1Q5M775 1068 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 BMP15O95972 392 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 PDE6AP16499 860 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.9■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RREB1Q92766 1687 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM14Q14142 442 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP2R5BQ15173 497 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 RTN1Q16799 776 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 AIDAQ96BJ3 306 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.89■■□□□ 1.74
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIN1Q05586 938 aa25.89■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF827Q17R98 1081 aa25.89■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.89■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 TEX33O43247 280 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM71BQ8TC56 605 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 MED4Q9NPJ6 270 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 DOCK2Q92608 1830 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CTAGE8P0CG41 777 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.88■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNQ2O43526 872 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 SUSD4Q5VX71 490 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 SRLQ86TD4 932 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 NAPBQ9H115 298 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 CSRNP2Q9H175 543 aa25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO1CO00159 1063 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR93Q6P2C0 686 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.86■■□□□ 1.73
ANKRD54-201ENST00000215941 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms