RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nkx1-2P42580 305 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Irf5P56477 497 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Kif20aP97329 887 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Foxd1Q61345 456 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tekt3Q6X6Z7 490 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Amer2Q8CCJ4 672 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 OplahQ8K010 1288 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dppa3Q8QZY3 150 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mtmr4Q91XS1 1190 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 HlcsQ920N2 722 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ubxn11Q9D572 484 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TicrrQ8BQ33 1889 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zscan18E9PUD6 809 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Map2k1P31938 393 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ly6dP35459 127 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 B4galnt3Q6L8S8 986 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Htatsf1Q8BGC0 757 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cnot6lQ8VEG6 555 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Arih1Q9Z1K5 555 aa21.49■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Krt28A6BLY7 462 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nmt2O70311 529 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ftl1P29391 183 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ppm1jQ149T7 507 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam155aQ8CCS2 467 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ttll1Q91V51 423 aa21.48■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rnf41Q8BH75 317 aa21.47■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Shisa4Q8CA71 197 aa21.47■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bco2Q99NF1 532 aa21.47■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Leng1Q9DB98 261 aa21.47■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Prl7a2O54831 253 aa21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ptpn12P35831 775 aa21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 IrgqQ8VIM9 583 aa21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sapcd2Q9D818 391 aa21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Flot1O08917 428 aa21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nek9Q8K1R7 984 aa21.46■■□□□ 1.03
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm13128L7MU96 475 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MyocO70624 490 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pls1Q3V0K9 630 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sp8Q8BMJ8 486 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trmt112Q9DCG9 125 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sil1Q9EPK6 465 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmod4Q9JLH8 345 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dock2Q8C3J5 1828 aa21.45■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trim5E9PV98 497 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Copb2O55029 905 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rnf208Q8K0W3 265 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 BaatQ91X34 420 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 CenppQ9CZ92 286 aa21.44■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Alppl2P24823 529 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hoxc10P31257 342 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Morf4l1P60762 362 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Atp11aP98197 1187 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 QarsQ8BML9 775 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gjb1P28230 283 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hoxd10P28359 340 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Usp5P56399 858 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fbxo28Q8BIG4 368 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 DlatQ8BMF4 642 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Krt84Q99M73 603 aa21.43■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa21.42■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Siglec10Q80ZE3 688 aa21.42■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Adgra1Q8C4G9 578 aa21.42■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rgs19Q9CX84 216 aa21.42■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zbtb43Q9DAI4 467 aa21.42■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Skint3A7TZF0 458 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccdc174Q3U155 467 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Serpinb13Q8CDC0 389 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Casp12O08736 419 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PrkczQ02956 592 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Usp50Q6P8X6 390 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Arhgef6Q8K4I3 771 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bst2Q8R2Q8 172 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ttc8Q8VD72 515 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ak2Q9WTP6 239 aa21.41■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Myh7bA2AQP0 1941 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ugt1a5B2RT14 529 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mrgprb1Q3UG61 350 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ifit2Q64112 472 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ubxn10Q8BG34 277 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mlh1Q9JK91 760 aa21.4■■□□□ 1.02
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa21.39■■□□□ 1.01
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Myl3P09542 204 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms