RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027878.13

Prrx1-201, Transcript of Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrx1, Length 4,952 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa5.11□□□□□ -1.59
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm7735D3YX18 52 aa5.09□□□□□ -1.6
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Stard9Q80TF6 4561 aa5.07□□□□□ -1.6
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm17402F6Z0L5 76 aa5.06□□□□□ -1.6
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm19668J3QMD1 248 aa5.04□□□□□ -1.6
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa5.02□□□□□ -1.61
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Hectd4E9Q2E4 4418 aa4.99□□□□□ -1.61
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa4.99□□□□□ -1.61
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Vps13dB1ART2 4390 aa4.97□□□□□ -1.61
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dnah8Q91XQ0 4731 aa4.97□□□□□ -1.61
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lrp1bQ9JI18 4599 aa4.97□□□□□ -1.61
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dnah2P0C6F1 4456 aa4.94□□□□□ -1.62
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pkd1O08852 4293 aa4.92□□□□□ -1.62
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap3-2Q9D638 99 aa4.91□□□□□ -1.62
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa4.91□□□□□ -1.62
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm6358A0A087WPH4 74 aa4.89□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap19-9aF8WH65 55 aa4.89□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Herc2Q4U2R1 4836 aa4.87□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 ApobE9Q414 4505 aa4.86□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa4.86□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa4.85□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa4.84□□□□□ -1.63
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm9789Q8BIG3 52 aa4.83□□□□□ -1.64
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa4.81□□□□□ -1.64
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pkhd1E9PZ36 4059 aa4.79□□□□□ -1.64
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap1-5A2A590 122 aa4.79□□□□□ -1.64
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap4-2B1AQ85 167 aa4.77□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap12-1Q9Z287 130 aa4.75□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 HydinQ80W93 5154 aa4.75□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa4.75□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap3-1A2A591 98 aa4.74□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa4.74□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 SacsQ9JLC8 4582 aa4.74□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fat2Q5F226 4351 aa4.73□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ryr3A2AGL3 4863 aa4.72□□□□□ -1.65
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Vps13bQ80TY5 3993 aa4.68□□□□□ -1.66
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap17-1A2A5X6 109 aa4.66□□□□□ -1.66
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm11569B1AQB1 180 aa4.63□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap9-5A2A5X3 358 aa4.62□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa4.6□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm10061D3Z714 54 aa4.6□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce1gQ9D195 139 aa4.6□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa4.59□□□□□ -1.67
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa4.55□□□□□ -1.68
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap19-3Q925H6 87 aa4.55□□□□□ -1.68
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lrp2A2ARV4 4660 aa4.54□□□□□ -1.68
Prrx1-201ENSMUST00000027878 PcloQ9QYX7 5068 aa4.52□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa4.51□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap1-3A2A588 173 aa4.5□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa4.5□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa4.47□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa4.47□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fat3Q8BNA6 4555 aa4.46□□□□□ -1.69
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm11562A0PK51 136 aa4.45□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Birc6O88738 4882 aa4.44□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap19-1Q925H2 87 aa4.43□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Abca13Q5SSE9 5034 aa4.43□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 A0A1Y7VLE6 161 aa4.43□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa4.4□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce3bQ9CQM7 98 aa4.4□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Herc1E9PZP8 4859 aa4.4□□□□□ -1.7
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sprr2a3Q4KL71 83 aa4.4□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa4.4□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap22-2J3QNX6 67 aa4.38□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sprr2iO70560 76 aa4.38□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa4.38□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm11596B1AQB0 205 aa4.35□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sprr2fO70557 76 aa4.35□□□□□ -1.71
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm9112A2AI92 75 aa4.33□□□□□ -1.72
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mt4P47945 62 aa4.32□□□□□ -1.72
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce1lQ9D1G7 135 aa4.32□□□□□ -1.72
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap19-2Q925I0 141 aa4.31□□□□□ -1.72
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mt2P02798 61 aa4.31□□□□□ -1.72
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa4.25□□□□□ -1.73
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa4.22□□□□□ -1.73
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce3cQ91V05 98 aa4.19□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ubr4A2AN08 5180 aa4.19□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm11564A2A4L9 201 aa4.18□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm11563B1AQ90 168 aa4.18□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm11595B1AQA7 289 aa4.18□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap4-8B1AQA8 209 aa4.18□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap4-9B1AQA9 244 aa4.13□□□□□ -1.75
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce1bQ9D149 137 aa4.12□□□□□ -1.75
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce1fB9EJP6 147 aa4.08□□□□□ -1.76
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce1cQ9D1C5 147 aa4.08□□□□□ -1.76
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce1dQ9D731 133 aa4.08□□□□□ -1.76
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Muc5bE9Q5I3 4800 aa4.07□□□□□ -1.76
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fat4Q2PZL6 4981 aa4.06□□□□□ -1.76
Prrx1-201ENSMUST00000027878 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa4.04□□□□□ -1.76
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap19-4Q925H7 84 aa4.02□□□□□ -1.77
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lce3dE9Q8V1 98 aa4.01□□□□□ -1.77
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm10272F7CZ33 110 aa4.01□□□□□ -1.77
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Eppk1Q8R0W0 6548 aa4□□□□□ -1.77
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Krtap4-7Q9D732 168 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.2 ms