RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 NLRC3Q7RTR2 1065 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM192Q8IY95 271 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF214Q8ND24 703 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM13CQ8NE31 585 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 OR6P1Q8NGX9 317 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF507Q8TCN5 953 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ISL2Q96A47 359 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM87BQ96K49 555 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TM9SF2Q99805 663 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM105AQ9NUU6 356 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 GMIPQ9P107 970 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.32□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 KDM2BQ8NHM5 1336 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MEIS3P2A8K0S8 358 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 F8W735 103 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 FANCGO15287 622 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ADH5P11766 374 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 RAG1P15918 1043 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 GBP1P32455 592 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MLECQ14165 292 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 GNPTABQ3T906 1256 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 VHLLQ6RSH7 139 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 HID1Q8IV36 788 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PHACTR4Q8IZ21 702 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 LGR4Q9BXB1 951 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF208Q9H0X6 261 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 USP21Q9UK80 565 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAMTS8Q9UP79 889 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 LEMD3Q9Y2U8 911 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ACTL7BQ9Y614 415 aa3.31□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ESYT3A0FGR9 886 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD62A6NC57 917 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 C9IYK1 514 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 GNB5O14775 395 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TNFRSF10CO14798 259 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 UBOX5O94941 541 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TIAF1O95411 115 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 NFICP08651 508 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ELNP15502 786 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 COL8A1P27658 744 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC6A19Q695T7 634 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 FDX2Q6P4F2 183 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 CDH24Q86UP0 819 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 FBLIM1Q8WUP2 373 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SUGCTQ9HAC7 445 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 TACC3Q9Y6A5 838 aa3.3□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 RGS13O14921 159 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SART1O43290 800 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRN2O75325 713 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM153BP0C7A2 387 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 GLB1P16278 677 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 RAB6AP20340 208 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 NOS3P29474 1203 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PREPP48147 710 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 USP11P51784 963 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC7A5Q01650 507 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SQSTM1Q13501 440 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 RASGRF1Q13972 1273 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 MTERF2Q49AM1 385 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 SGO2Q562F6 1265 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PPFIBP1Q86W92 1011 aa3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SPTAN1-232ENST00000636483 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms