RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SWAP70Q9UH65 585 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB43O43298 467 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DTNBO60941 627 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NID2Q14112 1375 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CLRN2A0PK11 232 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT10BO00744 389 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NMT2O60551 498 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPY3P0CV98 308 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPY8P0CW00 308 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PI4KBQ9UBF8 816 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.264e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-215ENST00000628018 RCAN1P53805 252 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO1BO43795 1136 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 JAK2O60674 1132 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MICU3Q86XE3 530 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MICALL2Q8IY33 904 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKS1AQ92625 1134 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.14■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RCSD1Q6JBY9 416 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKHQ86XP1 1220 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 GPC2Q8N158 579 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL10Q9BUA6 226 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 MYH8P13535 1937 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 BRD1O95696 1058 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RXRAP19793 462 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SHMT1P34896 483 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM151AQ8WW52 585 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTNAP1P78357 1384 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8AA7E2F4 631 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SYT1P21579 422 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFRP00533 1210 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC27P30260 824 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM83AQ86UY5 434 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC18Q9H819 358 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF181Q9P0P0 153 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 ADD1P35611 737 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 VEZTQ9HBM0 779 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CPLX1O14810 134 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 STX6O43752 255 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 PDCP20941 246 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 TROAPQ12815 778 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX11Q96FC9 970 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-215ENST00000628018 DDAH1O94760 285 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 SLURP2P0DP57 97 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NOVP48745 357 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R5BQ15173 497 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NTRK3Q16288 839 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FANCBQ8NB91 859 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CSRNP1Q96S65 589 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRC5DQ9NZD1 345 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 H7C1D1 291 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CALM1P0DP23 149 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CALM2P0DP24 149 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CALM3P0DP25 149 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR1B1P15121 316 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 RTN1Q16799 776 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf131Q5VYM1 1079 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP133Q8WUM0 1156 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC17Q96LX7 622 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FDPSP14324 419 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.05■■■□□ 2.24
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