RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619785.1

SENP3-210, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-210ENST00000619785 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SENP3-210ENST00000619785 OTOFQ9HC10 1997 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-210ENST00000619785 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.51□□□□□ -0.89
SENP3-210ENST00000619785 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SENP3-210ENST00000619785 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SENP3-210ENST00000619785 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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SENP3-210ENST00000619785 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SENP3-210ENST00000619785 PROSER3Q2NL68 480 aa9.48□□□□□ -0.89
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SENP3-210ENST00000619785 A0A1W2PRU2 124 aa9.45□□□□□ -0.9
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SENP3-210ENST00000619785 COPS6Q7L5N1 327 aa9.45□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.45□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 PODNQ7Z5L7 613 aa9.45□□□□□ -0.9
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SENP3-210ENST00000619785 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
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SENP3-210ENST00000619785 ADH1CP00326 375 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 HOXB7P09629 217 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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SENP3-210ENST00000619785 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 NR5A1Q13285 461 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 SPRYD7Q5W111 196 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.44□□□□□ -0.9
SENP3-210ENST00000619785 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.44□□□□□ -0.9
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