RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	F13A1	P00488	732 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	PICALM	Q13492	652 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	DDX11	Q96FC9	970 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	SENP2	Q9HC62	589 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		32.51	■■■□□ 2.8
BRF1-221	ENST00000619151	PLCD1	P51178	756 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	EVX2	Q03828	476 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	PPP2R5B	Q15173	497 aa		32.5	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		32.5	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		32.49	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151		H3BQV1	296 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	OGFOD1	Q8N543	542 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	HLA-DOA	P06340	250 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CALM1	P0DP23	149 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CALM2	P0DP24	149 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CALM3	P0DP25	149 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	TFAP4	Q01664	338 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	RTN1	Q16799	776 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CFAP100	Q494V2	611 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	MCTP1	Q6DN14	999 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	IDI2	Q9BXS1	227 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	DTNB	O60941	627 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	TSPY3	P0CV98	308 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	TSPY8	P0CW00	308 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	CDK8	P49336	464 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRF1-221	ENST00000619151	DDAH1	O94760	285 aa		32.45	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	SWAP70	Q9UH65	585 aa		32.45	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		32.45	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	RXRA	P19793	462 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	MICALL2	Q8IY33	904 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	RGS22	Q8NE09	1264 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	MYL10	Q9BUA6	226 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	RASA1	P20936	1047 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	DGKH	Q86XP1	1220 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	CDC27	P30260	824 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	FANCB	Q8NB91	859 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	STK36	Q9NRP7	1315 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	SHTN1	A0MZ66	631 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151		H7C1D1	291 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	ANKS1A	Q92625	1134 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	EHD4	Q9H223	541 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	IFNAR1	P17181	557 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	GABPA	Q06546	454 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	NFIA	Q12857	509 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	EPS15	P42566	896 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	DLGAP5	Q15398	846 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	WASF1	Q92558	559 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	KAT14	Q9H8E8	782 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRF1-221	ENST00000619151	ENTPD3	O75355	529 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	NTRK3	Q16288	839 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	C8orf76	Q96K31	380 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		32.37	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	NMT2	O60551	498 aa		32.37	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	SPDYE6	P0CI01	402 aa		32.37	■■■□□ 2.77

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