RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L10C9JJH3 530 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 BCRP11274 1271 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 BACE1P56817 501 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 DCTPP1Q9H773 170 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 GH2P01242 217 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 FEZ1Q99689 392 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 EHD4Q9H223 541 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF333Q96JL9 665 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 ARMT1Q9H993 441 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 POTEFA5A3E0 1075 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ADD2P35612 726 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 LCORLQ8N3X6 602 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 COA7Q96BR5 231 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 MBD4O95243 580 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 CTGFP29279 349 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 GRK4P32298 578 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PLCD1P51178 756 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 UBXN2AP68543 259 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 JAG1P78504 1218 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PRKCZQ05513 592 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 UBE3CQ15386 1083 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 FOCADQ5VW36 1801 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 USP14P54578 494 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 CRBNQ96SW2 442 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 GABRQQ9UN88 632 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 MYH1P12882 1939 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ERC2O15083 957 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PRKAB2O43741 272 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 SWAP70Q9UH65 585 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ADCY3O60266 1144 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 SHMT1P34896 483 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 FLT3LGP49771 235 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 SIPA1L1O43166 1804 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 CYP2D6P10635 497 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 HERVK_113P62684 666 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 PTPRFP10586 1907 aa23.06■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 SEPT2Q15019 361 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 RNF208Q9H0X6 261 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.05■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L15C9J2P7 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L11C9JVI0 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L18D6R9N7 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L22D6RA61 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L19D6RCP7 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L20D6RJB6 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 GABPAQ06546 454 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 USP17L24Q0WX57 530 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 MTFR1Q15390 333 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.04■■□□□ 1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms