RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606884.1

GMDS-AS1-215, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF576Q9H609 170 aa9.62□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.6□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.6□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GPR142Q7Z601 462 aa9.6□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.6□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 HERVK_113P62684 666 aa9.59□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SPP2Q13103 211 aa9.59□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MAP2K5Q13163 448 aa9.59□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.59□□□□□ -0.87
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 GPR37L1O60883 481 aa9.58□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 BMP1P13497 986 aa9.58□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ERVK-9P63128 1117 aa9.58□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.58□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 WDR18Q9BV38 432 aa9.58□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.57□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 USP17L5A8MUK1 530 aa9.57□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.57□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.57□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.57□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CLTBP09497 229 aa9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ITGB8P26012 769 aa9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CAP2P40123 477 aa9.56□□□□□ -0.88
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GMDS-AS1-215ENST00000606884 RASIP1Q5U651 963 aa9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KAZALD1Q96I82 304 aa9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.56□□□□□ -0.88
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