RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SHISA4Q96DD7 197 aa25.04■■□□□ 1.6
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCN7AQ01118 1682 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RFC4P35249 363 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CBX1P83916 185 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LONRF3Q496Y0 759 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQCA1Q86XH1 822 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1B0GUL6 1792 aa25.02■■□□□ 1.6
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM205CA6NFA0 338 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RGL2O15211 777 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXN1O15353 648 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMC2O95347 1197 aa25.01■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.01■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PKN1Q16512 942 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RILPL1Q5EBL4 403 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFNKQ9P0W0 207 aa25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TROAPQ12815 778 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NFIXQ14938 502 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CASZ1Q86V15 1759 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.98■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FUT2Q10981 343 aa24.98■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPREP23469 700 aa24.97■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa24.97■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XBP1P17861 261 aa24.96■■□□□ 1.59
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP1A3P13637 1013 aa24.95■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP2R5BQ15173 497 aa24.95■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP49Q70CQ1 688 aa24.95■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNBD1Q8NA66 436 aa24.95■■□□□ 1.59
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPY2A6NKD2 308 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SKILP12757 684 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TPM4P67936 248 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRIK5Q16478 980 aa24.95■■□□□ 1.58
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.95■■□□□ 1.58
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRAPQ13588 217 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYH2Q9UKX2 1941 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSRNP2Q9H175 543 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ORC4O43929 436 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CALM1P0DP23 149 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CALM2P0DP24 149 aa24.93■■□□□ 1.58
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