RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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HERC3-212ENST00000597259 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.49□□□□□ -1.21
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HERC3-212ENST00000597259 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.49□□□□□ -1.21
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HERC3-212ENST00000597259 TMF1P82094 1093 aa7.46□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 STOML1Q9UBI4 398 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 RTL1A6NKG5 1358 aa7.46□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 MUC3BQ9H195 1237 aa7.43□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.43□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.42□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 FLT4P35916 1363 aa7.42□□□□□ -1.22
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HERC3-212ENST00000597259 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 C5P01031 1676 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 ADAM11O75078 769 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 SPINK2P20155 84 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 CDC27P30260 824 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 HYAL2Q12891 473 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-212ENST00000597259 SLC15A2Q16348 729 aa7.41□□□□□ -1.22
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