RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 DHX58Q96C10 678 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 FOXN1O15353 648 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MBD4O95243 580 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MYL5Q02045 173 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PNOCQ13519 176 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 APOA5Q6Q788 366 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 EFCC1Q9HA90 598 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MAP2K7O14733 419 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PDE8BO95263 885 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ACTN2P35609 894 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 VGLL2Q8N8G2 317 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.19□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 20.9
FCHO1-218ENST00000596951 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 KCNJ14Q9UNX9 436 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CMA1P23946 247 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 GRIN1Q05586 938 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 RASGRF1Q13972 1273 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 GOLGA1Q92805 767 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 FANCLQ9NW38 375 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TXLNAP40222 546 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BCAMP50895 628 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IQUBQ8NA54 791 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC151A5D8V7 595 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 GOLGA8AA7E2F4 631 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SHC4Q6S5L8 630 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 DESI2Q9BSY9 194 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ZSWIM5Q9P217 1185 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ZBTB43O43298 467 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SYKP43405 635 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PDILTQ8N807 584 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 NAPBQ9H115 298 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 VPS18Q9P253 973 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 GNPATO15228 680 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CAMTA2O94983 1202 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ADKP55263 362 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF827Q17R98 1081 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 FOXR1Q6PIV2 292 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 LCORLQ8N3X6 602 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TC2NQ8N9U0 490 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 NUP133Q8WUM0 1156 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 ZMYM6O95789 1325 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BTBD18B2RXH4 712 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MCM6Q14566 821 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BRD3Q15059 726 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SUSD4Q5VX71 490 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 LY9Q9HBG7 655 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PDE4BQ07343 736 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 BRAPQ7Z569 592 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 STX10O60499 249 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IARSP41252 1262 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 NR5A1Q13285 461 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SPATA5Q8NB90 893 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-218ENST00000596951 SDR42E1Q8WUS8 393 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms