RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 WDR18Q9BV38 432 aa24.36■■□□□ 1.49
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UBXN6-206ENST00000590466 USP17L10C9JJH3 530 aa24.26■■□□□ 1.47
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UBXN6-206ENST00000590466 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.25■■□□□ 1.47
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UBXN6-206ENST00000590466 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.23■■□□□ 1.47
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UBXN6-206ENST00000590466 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
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UBXN6-206ENST00000590466 C12orf42Q96LP6 360 aa24.22■■□□□ 1.47
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UBXN6-206ENST00000590466 AKR1B1P15121 316 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-206ENST00000590466 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.475e-7■□□□□ 10.5
UBXN6-206ENST00000590466 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-206ENST00000590466 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-206ENST00000590466 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-206ENST00000590466 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-206ENST00000590466 PNMA3Q9UL41 463 aa24.21■■□□□ 1.47
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