RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ZAP70P43403 619 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 RTN1Q16799 776 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM26DQ5JW98 314 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 MSL1Q68DK7 614 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC16Q8NEE8 873 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 USP16Q9Y5T5 823 aa9.8□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP5O75197 1615 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 PAPPAQ13219 1627 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CD2APQ9Y5K6 639 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 CASZ1Q86V15 1759 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 A1BGP04217 495 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 GYS1P13807 737 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 GSK3AP49840 483 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF5P55010 431 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 ORC1Q13415 861 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 TEAD4Q15561 434 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF15Q8N660 670 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 IFT43Q96FT9 208 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 NARFQ9UHQ1 456 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-216ENST00000590105 C4BP0C0L5 1744 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC35F4A4IF30 521 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 TM4SF1P30408 202 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC184Q52MB2 194 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 XAGE2Q96GT9 111 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SERTM1A2A2V5 107 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 APAF1O14727 1248 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 LILRA1O75019 489 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 MMP10P09238 476 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 TBCELQ5QJ74 424 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 IFT57Q9NWB7 429 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 C5P01031 1676 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF831Q5JPB2 1677 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 MRC1P22897 1456 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 EML1O00423 815 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 OPLAHO14841 1288 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 TGFB2P61812 414 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR162Q16538 588 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SPC25Q9HBM1 224 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 STRIP2Q9ULQ0 834 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 CHL1O00533 1208 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJC6O75061 913 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF217Q8TC41 542 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
EFTUD2-216ENST00000590105 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms