RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589266.5

CIRBP-223, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-223	ENST00000589266	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	PTPN18	Q99952	460 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	MCC	P23508	829 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	NFIA	Q12857	509 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	HSPA4	P34932	840 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	ARHGEF6	Q15052	776 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	RNF20	Q5VTR2	975 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	FAM151A	Q8WW52	585 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	RASA3	Q14644	834 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	NBPF11	Q86T75	865 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	KCNB2	Q92953	911 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF333	Q96JL9	665 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	MYH1	P12882	1939 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	CAP1	Q01518	475 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	PICALM	Q13492	652 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	CTR9	Q6PD62	1173 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		29.76	■■■□□ 2.36
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L12	C9JPN9	530 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	USP17L21	D6R901	530 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	CACNB3	P54284	484 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	TTC6	Q86TZ1	520 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	LAMA4	Q16363	1823 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF213	O14771	459 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	C12orf60	Q5U649	245 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	OPTN	Q96CV9	577 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ELP3	Q9H9T3	547 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ANAPC15	P60006	121 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC27A2	O14975	620 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	PPARA	Q07869	468 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	IL17RA	Q96F46	866 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	HLA-DOA	P06340	250 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	CYP21A2	P08686	494 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	TCP10	Q12799	353 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	EHD4	Q9H223	541 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	NT5C2	P49902	561 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	PALD1	Q9ULE6	856 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	KRT32	Q14532	448 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
CIRBP-223	ENST00000589266	GTF2A2	P52657	109 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	OTOF	Q9HC10	1997 aa		29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	FGR	P09769	529 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	CCL15	Q16663	113 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	HOOK2	Q96ED9	719 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		29.68	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	PLCD1	P51178	756 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	HAND2	P61296	217 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	TEPSIN	Q96N21	525 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		29.67	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	CYP2D6	P10635	497 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	MAP3K9	P80192	1104 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	GABPA	Q06546	454 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	RASEF	Q8IZ41	740 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.66	■■■□□ 2.34
CIRBP-223	ENST00000589266	NBPF3	Q9H094	633 aa		29.66	■■■□□ 2.34

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