RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.26■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.26■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 C19orf81C9J6K1 198 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 ADCY3O60266 1144 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 HMMRO75330 724 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 GJB1P08034 283 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 CCL5P13501 91 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 MTMR2Q13614 643 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 EHD4Q9H223 541 aa22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 GDF11O95390 407 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 GJA8P48165 433 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 COA7Q96BR5 231 aa22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 USP17L10C9JJH3 530 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 RAB11FIP3O75154 756 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 USP5P45974 858 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 RNF208Q9H0X6 261 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.21■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 TTC6Q86TZ1 520 aa22.21■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.21■■□□□ 1.15
CTIF-206ENST00000588345 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 ELNP15502 786 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 APBB1O00213 710 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 GH2P01242 217 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 INHAP05111 366 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 PDE6AP16499 860 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 CAPN2P17655 700 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 C12orf42Q96LP6 360 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 GJD2Q9UKL4 321 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 PLXNB2O15031 1838 aa22.19■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.18■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.18■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 PDE3AQ14432 1141 aa22.18■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 GOLIM4O00461 696 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 SGPL1O95470 568 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 HERVK_113P62684 666 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.17■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 SHMT1P34896 483 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 PLCD1P51178 756 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 GABPAQ06546 454 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.16■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 ATP5JP18859 108 aa22.15■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.15■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.15■■□□□ 1.14
CTIF-206ENST00000588345 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.14■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 CEP290O15078 2479 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 HMGCRP04035 888 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ADD2P35612 726 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 USP14P54578 494 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 LCORLQ8N3X6 602 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 CABP5Q9NP86 173 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 MYH7P12883 1935 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 H0YGN5 161 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 PEX10O60683 326 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 GUCY1A2P33402 732 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ERVK-9P63128 1117 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 ERVK-24P63145 666 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.12■■□□□ 1.13
CTIF-206ENST00000588345 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.12■■□□□ 1.13
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