RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.87	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	HAND2	P61296	217 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	FKBP1B	P68106	108 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC17	Q96LX7	622 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MTA3	Q9BTC8	594 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	GINM1	Q9NU53	330 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		10.86	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	INPP5B	P32019	993 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	EVC	P57679	992 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	SEC23A	Q15436	765 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MKL1	Q969V6	931 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	TTC14	Q96N46	770 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	AKR1B1	P15121	316 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	MOB2	Q70IA6	237 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TMUB2-208	ENST00000587775	PRDM1	O75626	825 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	PDE4B	Q07343	736 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775		A0A1W2PRG0	241 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775		B4E1Z4	1266 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	KDM4A	O75164	1064 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	PTPRA	P18433	802 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	GJA5	P36382	358 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	TFAP4	Q01664	338 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	MOGS	Q13724	837 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	VGLL4	Q14135	290 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	KRT32	Q14532	448 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	NCOA7	Q8NI08	942 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	KRT23	Q9C075	422 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SENP2	Q9HC62	589 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	NYAP2	Q9P242	653 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	MYH8	P13535	1937 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	NMT2	O60551	498 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	LIFR	P42702	1097 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SEPT2	Q15019	361 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	RUFY3	Q7L099	469 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	DGKH	Q86XP1	1220 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ESR2	Q92731	530 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	CEP95	Q96GE4	821 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TMUB2-208	ENST00000587775	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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