RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	PRDM1	O75626	825 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	FKBP1B	P68106	108 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232		B4E1Z4	1266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	TRAF5	O00463	557 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	KDM4A	O75164	1064 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	CAP2	P40123	477 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	FSTL1	Q12841	308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-211	ENST00000582232	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	MCM5	P33992	734 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	NOV	P48745	357 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TFAP4	Q01664	338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ASNS	P08243	561 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	AKR1B1	P15121	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ANTXR2	P58335	489 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	RABEP1	Q15276	862 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	IQCA1	Q86XH1	822 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	JAG1	P78504	1218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CST9	Q5W186	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	TTC14	Q96N46	770 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	PRC1	O43663	620 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	GDF11	O95390	407 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	GH2	P01242	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	INPP5B	P32019	993 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	CPA1	P15085	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	LIFR	P42702	1097 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	NEK4	P51957	841 aa		13.54	□□□□□ -0.24
GGA3-211	ENST00000582232	PRKG1	Q13976	671 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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