RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa36.71■■■■□ 3.47
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRMT2P55345 433 aa36.7■■■■□ 3.47
CTDNEP1-206ENST00000571409 LCORLQ8N3X6 602 aa36.7■■■■□ 3.47
CTDNEP1-206ENST00000571409 PNMA3Q9UL41 463 aa36.7■■■■□ 3.47
CTDNEP1-206ENST00000571409 MTMR2Q13614 643 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLFNL1Q499Z3 407 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 ECHDC1Q9NTX5 307 aa36.69■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYH7P12883 1935 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLCD1P51178 756 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 BACE1P56817 501 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 TATDN1Q6P1N9 297 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 NBPF11Q86T75 865 aa36.68■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 MGAMO43451 1857 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 OSBPP22059 807 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 HOXD10P28358 340 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 SDR42E1Q8WUS8 393 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF333Q96JL9 665 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 ARMT1Q9H993 441 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 SRRDQ9UH36 339 aa36.67■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 MCM9Q9NXL9 1143 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 GH2P01242 217 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 FCGRTP55899 365 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 GPATCH3Q96I76 525 aa36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 POTEFA5A3E0 1075 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP17L10C9JJH3 530 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 CHGBP05060 677 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 CRBNQ96SW2 442 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMOD4Q9NZQ9 345 aa36.64■■■■□ 3.46
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYPNQ86TC9 1320 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 C19orf81C9J6K1 198 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 MBD4O95243 580 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBE3CQ15386 1083 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 SH3TC2Q8TF17 1288 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 CENPFP49454 3210 aa36.63■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa36.62■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 SHMT1P34896 483 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 TSHZ3Q63HK5 1081 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAET1EQ8TD07 263 aa36.61■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRKAB2O43741 272 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 EVX2Q03828 476 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 GABPAQ06546 454 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCB5Q2M3G0 1257 aa36.6■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRKCZQ05513 592 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM110CQ1W6H9 321 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM106CQ9BVX2 250 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYCP01106 439 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAB3GAP1Q15042 981 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 CABP5Q9NP86 173 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-206ENST00000571409 CYP2D6P10635 497 aa36.57■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 GABRQQ9UN88 632 aa36.56■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP17L2Q6R6M4 530 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 KBTBD3Q8NAB2 608 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 FEZ1Q99689 392 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 EMILIN3Q9NT22 766 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 GRK4P32298 578 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 EN2P19622 333 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa36.53■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 TTC41PQ6P2S7 1318 aa36.52■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 GUCY1A2P33402 732 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC44A5Q8NCS7 719 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 DYNLL2Q96FJ2 89 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 DDRGK1Q96HY6 314 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 C12orf42Q96LP6 360 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 SWAP70Q9UH65 585 aa36.51■■■■□ 3.44
CTDNEP1-206ENST00000571409 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 FLT3LGP49771 235 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 SEPT2Q15019 361 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 AMOTL1Q8IY63 956 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 ACER1Q8TDN7 264 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 COA7Q96BR5 231 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYH8P13535 1937 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP14P54578 494 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 HERVK_113P62684 666 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 MORF4L1Q9UBU8 362 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 TAOK2Q9UL54 1235 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP17L12C9JPN9 530 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 USP17L21D6R901 530 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 ERC2O15083 957 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 MTFR1Q15390 333 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-206ENST00000571409 C12orf60Q5U649 245 aa36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms