RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 LNPKQ9C0E8 428 aa25.34■■□□□ 1.65
SNAP23-216ENST00000568331 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.34■■□□□ 1.65
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SNAP23-216ENST00000568331 PRKAB2O43741 272 aa25.33■■□□□ 1.65
SNAP23-216ENST00000568331 IGHDP01880 384 aa25.33■■□□□ 1.65
SNAP23-216ENST00000568331 ARHGEF6Q15052 776 aa25.33■■□□□ 1.65
SNAP23-216ENST00000568331 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.33■■□□□ 1.65
SNAP23-216ENST00000568331 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.33■■□□□ 1.65
SNAP23-216ENST00000568331 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.33■■□□□ 1.65
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SNAP23-216ENST00000568331 STAP2Q9UGK3 403 aa25.33■■□□□ 1.65
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SNAP23-216ENST00000568331 WDR18Q9BV38 432 aa25.32■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.31■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 PDE1AP54750 535 aa25.31■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.31■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM17Q9Y577 477 aa25.31■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.31■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 GH2P01242 217 aa25.3■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 JAG1P78504 1218 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 OSBP2Q969R2 916 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 EFCC1Q9HA90 598 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.29■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 SHMT1P34896 483 aa25.28■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.28■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 SWAP70Q9UH65 585 aa25.28■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 PNMA3Q9UL41 463 aa25.28■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 C19orf81C9J6K1 198 aa25.27■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 USP17L10C9JJH3 530 aa25.27■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 USP17L12C9JPN9 530 aa25.27■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 USP17L21D6R901 530 aa25.27■■□□□ 1.64
SNAP23-216ENST00000568331 CYP2C8P10632 490 aa25.27■■□□□ 1.64
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SNAP23-216ENST00000568331 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAP23-216ENST00000568331 OSBPP22059 807 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAP23-216ENST00000568331 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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SNAP23-216ENST00000568331 SBK1Q52WX2 424 aa25.21■■□□□ 1.63
SNAP23-216ENST00000568331 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.21■■□□□ 1.63
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SNAP23-216ENST00000568331 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.21■■□□□ 1.63
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SNAP23-216ENST00000568331 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 GNRH1P01148 92 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 BCRP11274 1271 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 USP14P54578 494 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 SEPT2Q15019 361 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAP23-216ENST00000568331 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.2■■□□□ 1.62
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