RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
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CHTF18-216ENST00000565787 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.42■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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CHTF18-216ENST00000565787 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.4■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.4■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 CDK8P49336 464 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 PRMT2P55345 433 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 NUCB1Q02818 461 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 SEPT2Q15019 361 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-216ENST00000565787 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.39■■■□□ 2.14
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