RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 NID1P14543 1247 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 NUDT8Q8WV74 236 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 IP6K1Q92551 441 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 NBPF4Q96M43 638 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 HACL1Q9UJ83 578 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 VCANP13611 3396 aa6.46□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.45□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 IFT43Q96FT9 208 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 RPS6KA4O75676 772 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 GATA4P43694 442 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 COX20Q5RI15 118 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 SYNE4Q8N205 404 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 USP20Q9Y2K6 914 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 TRPA1O75762 1119 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 SASH3O75995 380 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 DOC2BQ14184 412 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 GRIK4Q16099 956 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 OCLNQ16625 522 aa6.43□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.43□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.43□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 NAGPAQ9UK23 515 aa6.43□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 H0YIN7 160 aa6.42□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.42□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.41□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.41□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.41□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 KDRP35968 1356 aa6.41□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 C16orf46Q6P387 395 aa6.4□□□□□ -1.38
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TMOD3-210ENST00000561408 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.4□□□□□ -1.38
TMOD3-210ENST00000561408 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.4□□□□□ -1.39
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.39□□□□□ -1.39
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