RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 ADCY3O60266 1144 aa24.43■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 HLA-DOAP06340 250 aa24.43■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 C19orf81C9J6K1 198 aa24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 MTMR2Q13614 643 aa24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 RNF208Q9H0X6 261 aa24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 COG6Q9Y2V7 657 aa24.42■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 GDF11O95390 407 aa24.41■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.41■■□□□ 1.5
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MFGE8-208ENST00000558773 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.41■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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MFGE8-208ENST00000558773 EHD4Q9H223 541 aa24.4■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.4■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.4■■□□□ 1.5
MFGE8-208ENST00000558773 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.4■■□□□ 1.5
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MFGE8-208ENST00000558773 RAB11FIP3O75154 756 aa24.37■■□□□ 1.49
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MFGE8-208ENST00000558773 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.36■■□□□ 1.49
MFGE8-208ENST00000558773 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
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MFGE8-208ENST00000558773 PDE6AP16499 860 aa24.35■■□□□ 1.49
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MFGE8-208ENST00000558773 HERVK_113P62684 666 aa24.35■■□□□ 1.49
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MFGE8-208ENST00000558773 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
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MFGE8-208ENST00000558773 ERVK-9P63128 1117 aa24.28■■□□□ 1.48
MFGE8-208ENST00000558773 ERVK-24P63145 666 aa24.28■■□□□ 1.48
MFGE8-208ENST00000558773 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.28■■□□□ 1.48
MFGE8-208ENST00000558773 LCORLQ8N3X6 602 aa24.28■■□□□ 1.48
MFGE8-208ENST00000558773 ACER1Q8TDN7 264 aa24.28■■□□□ 1.48
MFGE8-208ENST00000558773 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
MFGE8-208ENST00000558773 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.28■■□□□ 1.48
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