RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
RBM23-231	ENST00000557549	APPBP2	Q92624	585 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RBM23-231	ENST00000557549		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	HLA-DOA	P06340	250 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SPP2	Q13103	211 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	C17orf99	Q6UX52	265 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TTC6	Q86TZ1	520 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	LCORL	Q8N3X6	602 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	EFCC1	Q9HA90	598 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CPA4	Q9UI42	421 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L5	A8MUK1	530 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GDF11	O95390	407 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	NEFL	P07196	543 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CYP2C8	P10632	490 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PLCD1	P51178	756 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	FSD1	Q9BTV5	496 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	EHD4	Q9H223	541 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ARMT1	Q9H993	441 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GINM1	Q9NU53	330 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PRKAB2	O43741	272 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	MBD4	O95243	580 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GNAT2	P19087	354 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SOX10	P56693	466 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	EVX2	Q03828	476 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CTGF	P29279	349 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	RGS19	P49795	217 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	HMGCS2	P54868	508 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TREML2	Q5T2D2	321 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ASNS	P08243	561 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	CYP2D6	P10635	497 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	OSBP2	Q969R2	916 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	WDR18	Q9BV38	432 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	MYH8	P13535	1937 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	BCR	P11274	1271 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	KIF22	Q14807	665 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	SMIM22	K7EJ46	135 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	HIP1	O00291	1037 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	GH2	P01242	217 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	SHMT1	P34896	483 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PSMC4	P43686	418 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	BACE1	P56817	501 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	GABPA	Q06546	454 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	MTMR2	Q13614	643 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGEF6	Q15052	776 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM47	Q96LD4	638 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	HTT	P42858	3142 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L10	C9JJH3	530 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	GPAA1	O43292	621 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PDE4A	P27815	886 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	SBK1	Q52WX2	424 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	SWAP70	Q9UH65	585 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RBM23-231	ENST00000557549	C12orf60	Q5U649	245 aa		14.75	□□□□□ -0.05

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