RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ESR2Q92731 530 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH6P13533 1939 aa22.94■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 POSTNQ15063 836 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMTC2Q8N394 836 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCND1Q9NSA2 647 aa22.93■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CSRNP2Q9H175 543 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 INTS13Q9NVM9 706 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CACNA1SQ13698 1873 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 WNT7AO00755 349 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 PKN1Q16512 942 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF18AQ8NI77 898 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.92■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.91■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LAMB2P55268 1798 aa22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYCP1Q15431 976 aa22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.9■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 RREB1Q92766 1687 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087X0B3 334 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 NMT2O60551 498 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 FUT2Q10981 343 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 VSTM4Q8IW00 320 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MED15Q96RN5 788 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTA3Q9BTC8 594 aa22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASP1P29466 404 aa22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBE4AQ14139 1066 aa22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPSTI1Q96J88 318 aa22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 JAG2Q9Y219 1238 aa22.89■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTR9Q6PD62 1173 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L12C9JPN9 530 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP17L21D6R901 530 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPHP1O15259 732 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CBFA2T2O43439 604 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMARCE1Q969G3 411 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.88■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 RCAN1P53805 252 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX58Q96C10 678 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A1B0GUL6 1792 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TROAPQ12815 778 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.87■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 MORC3Q14149 939 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 ELF2Q15723 593 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 AFMP43652 599 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM75PA6NK02 468 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT2P35908 639 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOMER1Q86YM7 354 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMX1Q9H3N1 280 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASZ1Q86V15 1759 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRDCO43847 1150 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms