RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.19■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 CENPFP49454 3210 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SMC5Q8IY18 1101 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 OSBP2Q969R2 916 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 WDR18Q9BV38 432 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 GH2P01242 217 aa25.17■■□□□ 1.62
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CS-222ENST00000550996 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.17■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 MYH7P12883 1935 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 ERC2O15083 957 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 STAP2Q9UGK3 403 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.16■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 CTGFP29279 349 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 MTMR2Q13614 643 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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CS-222ENST00000550996 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 GINM1Q9NU53 330 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 BCRP11274 1271 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 APPBP2Q92624 585 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 LNPKQ9C0E8 428 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.14■■□□□ 1.62
CS-222ENST00000550996 M0R2C6 588 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 GUCY1A2P33402 732 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 PDE1AP54750 535 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 BACE1P56817 501 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.13■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.12■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.12■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 USP17L12C9JPN9 530 aa25.11■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 USP17L21D6R901 530 aa25.11■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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CS-222ENST00000550996 C12orf60Q5U649 245 aa25.11■■□□□ 1.61
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CS-222ENST00000550996 FSD1Q9BTV5 496 aa25.1■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 USP17L10C9JJH3 530 aa25.09■■□□□ 1.61
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CS-222ENST00000550996 NUCB1Q02818 461 aa25.09■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 ACER1Q8TDN7 264 aa25.09■■□□□ 1.61
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CS-222ENST00000550996 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
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CS-222ENST00000550996 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.08■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.08■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CS-222ENST00000550996 BRCA2P51587 3418 aa25.08■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.07■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 C19orf81C9J6K1 198 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 PSMC4P43686 418 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 CDK8P49336 464 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 SOX10P56693 466 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.06■■□□□ 1.6
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CS-222ENST00000550996 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.06■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 SWAP70Q9UH65 585 aa25.06■■□□□ 1.6
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CS-222ENST00000550996 KIF22Q14807 665 aa25.05■■□□□ 1.6
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CS-222ENST00000550996 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
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CS-222ENST00000550996 SBK1Q52WX2 424 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.04■■□□□ 1.6
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CS-222ENST00000550996 EVI5LQ96CN4 794 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.04■■□□□ 1.6
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