RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 GRK4P32298 578 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 ZP2Q05996 745 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 LETMD1Q6P1Q0 360 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TMC4Q7Z404 712 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 MFSD4AQ8N468 514 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 MIPEPQ99797 713 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PARP2Q9UGN5 583 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.02□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 USP31Q70CQ4 1352 aa9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 CYP7A1P22680 504 aa9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 KIR3DL1P43629 444 aa9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 CDK8P49336 464 aa9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM168AQ92567 244 aa9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.01□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PDE4BQ07343 736 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 SEPT6Q14141 434 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC6A19Q695T7 634 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 THAP5Q7Z6K1 395 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 RNF19AQ9NV58 838 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAM30Q9UKF2 790 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 C8AP07357 584 aa8.99□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 ERCC3P19447 782 aa8.99□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PSMD2Q13200 908 aa8.99□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.99□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.99□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 ITGAEP38570 1179 aa8.98□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.98□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.98□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.98□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.98□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PRR33A8MZF0 331 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 PGRP06401 933 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 RIN3Q8TB24 985 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM87BQ96K49 555 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.97□□□□□ -0.97
GNPTAB-208ENST00000550718 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CTSHP09668 335 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 ETV3P41162 512 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 FZD5Q13467 585 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 MAP3K11Q16584 847 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 PHC3Q8NDX5 983 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC120Q96HB5 630 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CRELD1Q96HD1 420 aa8.96□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 AFMP43652 599 aa8.95□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.95□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.95□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 SORBS3O60504 671 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CILPO75339 1184 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 GDNFP39905 211 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 JAG1P78504 1218 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 LMNB2Q03252 620 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 KCNMB1Q16558 191 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.93□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM221AA4D161 298 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 TNK2Q07912 1038 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 PWP1Q13610 501 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.92□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 H3BS24 57 aa8.91□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CBX7O95931 251 aa8.91□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CDH24Q86UP0 819 aa8.91□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.91□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 BPNT1O95861 308 aa8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 UBE2FQ969M7 185 aa8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 RHOVQ96L33 236 aa8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.9□□□□□ -0.98
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.89□□□□□ -0.99
GNPTAB-208ENST00000550718 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GNPTAB-208ENST00000550718 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.89□□□□□ -0.99
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM84AQ96KN4 292 aa8.89□□□□□ -0.99
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM74Q96NL1 305 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms