RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ISL2Q96A47 359 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ERVFC1P60507 584 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 KCTD3Q9Y597 815 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 RAD21O60216 631 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 SP110Q9HB58 689 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 FANCAO15360 1455 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ARID3CA6NKF2 412 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 PHACTR2O75167 634 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 EOMESO95936 686 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 HECW1Q76N89 1606 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 PLCH2O75038 1416 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 PEX10O60683 326 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 SEMA7AO75326 666 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 SSPNQ14714 243 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 C8orf34Q49A92 452 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF385BQ569K4 471 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF576Q9H609 170 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 AKNAQ7Z591 1439 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 SASH1O94885 1247 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 HPXP02790 462 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 SLFN14P0C7P3 912 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 AP3B2Q13367 1082 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC120Q96HB5 630 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ADGRL1O94910 1474 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1W2PP55 124 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 RAPGEF3O95398 923 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 TNFRSF1AP19438 455 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 TSPOAP1O95153 1857 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZXDAP98168 799 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 TTC6Q86TZ1 520 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 MYLIPQ8WY64 445 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 TEPSINQ96N21 525 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ITPKAP23677 461 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PANK1Q8TE04 598 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF32Q9H0A6 362 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF14Q15058 1648 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PRR33A8MZF0 331 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 RAC2P15153 192 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 KRT82Q9NSB4 513 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 NTF4P34130 210 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF214Q8ND24 703 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 SGPP1Q9BX95 441 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRQ-204ENST00000549355 PCSK2P16519 638 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRQ-204ENST00000549355 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms