RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 EGFRP00533 1210 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 USP14P54578 494 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCNA1P78396 465 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ICA1Q05084 483 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 DLK2Q6UY11 383 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SLX4Q8IY92 1834 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 UBE3CQ15386 1083 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 FAM83AQ86UY5 434 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TNS4Q8IZW8 715 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CA12O43570 354 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 AOC2O75106 756 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PRELPP51888 382 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 NFIAQ12857 509 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ESR2Q92731 530 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 GOPCQ9HD26 462 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC69A6NI79 296 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 GH2P01242 217 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 VEGFBP49765 207 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 INHBEP58166 350 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC17Q96LX7 622 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 KAT14Q9H8E8 782 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SCN7AQ01118 1682 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CPLX1O14810 134 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 MARCH6O60337 910 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 RAET1EQ8TD07 263 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 COA7Q96BR5 231 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 KLRG1Q96E93 195 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SWAP70Q9UH65 585 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 FLOT1O75955 427 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 INPP5BP32019 993 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ADD2P35612 726 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CHMP4BP1P59074 171 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CPXCR1Q8N123 301 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 LCORLQ8N3X6 602 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 USP17L10C9JJH3 530 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PEX14O75381 377 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 HMGCS2P54868 508 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 NUCB1Q02818 461 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SKAP1Q86WV1 359 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CNGA1P29973 690 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 MAP2K2P36507 400 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SCYL3Q8IZE3 742 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ZBED4O75132 1171 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 DMTNQ08495 405 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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PTPRB-206ENST00000548122 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM17Q9Y577 477 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF609O15014 1411 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 PRKAB2O43741 272 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SDSP20132 328 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 SLC1A4P43007 532 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 DGKZQ13574 1117 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 GRIK5Q16478 980 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-206ENST00000548122 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.42□□□□□ -1.38
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