RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CYP27B1O15528 508 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CTAGE8P0CG41 777 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
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CS-202ENST00000542324 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MICU3Q86XE3 530 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MED15Q96RN5 788 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.98□□□□□ -0.49
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CS-202ENST00000542324 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 VPS18Q9P253 973 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 BMP15O95972 392 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SPAG1Q07617 926 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CUL4BQ13620 913 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SCARF1Q14162 830 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MTF1Q14872 753 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TTLL7Q6ZT98 887 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 PNKPQ96T60 521 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SLC12A7Q9Y666 1083 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 B4E1Z4 1266 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 DEXIO95424 95 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CSF1RP07333 972 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 RBL2Q08999 1139 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 GSDMAQ96QA5 445 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 KRT23Q9C075 422 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 ABCB6Q9NP58 842 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MYH6P13533 1939 aa11.97□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MYH3P11055 1940 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 TNS2Q63HR2 1409 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MCM6Q14566 821 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 CASP8Q14790 479 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 PTPN21Q16825 1174 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 MAP9Q49MG5 647 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 SLC35F6Q8N357 371 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 ORAI2Q96SN7 254 aa11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CS-202ENST00000542324 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.96□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 BTBD18B2RXH4 712 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 TEX33O43247 280 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 MAGEA9P43362 315 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 PPP2R5BQ15173 497 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 TMTC2Q8N394 836 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 STRN4Q9NRL3 753 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 LRP5O75197 1615 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 MYH8P13535 1937 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 VGLL3A8MV65 326 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 MCAMP43121 646 aa11.95□□□□□ -0.5
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CS-202ENST00000542324 ZNF827Q17R98 1081 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 FERMT2Q96AC1 680 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 BCORQ6W2J9 1755 aa11.95□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 DISP2A7MBM2 1401 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.94□□□□□ -0.5
CS-202ENST00000542324 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.94□□□□□ -0.5
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