RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NCOA7Q8NI08 942 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ESR2Q92731 530 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NEK1Q96PY6 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 FZD1Q9UP38 647 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 SIPA1L1O43166 1804 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 AKR1B1P15121 316 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 PSMA5P28066 241 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 INPP5BP32019 993 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 GUCY1A2P33402 732 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TFAP4Q01664 338 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TRDNQ13061 729 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 WRNIP1Q96S55 665 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MTA3Q9BTC8 594 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 B4E1Z4 1266 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 KDM4AO75164 1064 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ANTXR2P58335 489 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MOB2Q70IA6 237 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 FBXL16Q8N461 479 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ANKS1AQ92625 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 MYH1P12882 1939 aa14.58□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
LMO3-217ENST00000537757 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 GH2P01242 217 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 ASNSP08243 561 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TSPY3P0CV98 308 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TSPY8P0CW00 308 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 PRKG1Q13976 671 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 VGLL4Q14135 290 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 IL27Q8NEV9 243 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TSPY2A6NKD2 308 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 GDF11O95390 407 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 PTPRAP18433 802 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 RPS6KB1P23443 525 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 MCM5P33992 734 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 RUFY3Q7L099 469 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 MKL1Q969V6 931 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TTC14Q96N46 770 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 CABP5Q9NP86 173 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TOMM22Q9NS69 142 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 SEPT2Q15019 361 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 SEC23AQ15436 765 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 DGKHQ86XP1 1220 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 WDR18Q9BV38 432 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 NYAP2Q9P242 653 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 LAMA4Q16363 1823 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-217ENST00000537757 USP17L5A8MUK1 530 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms