RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L5A8MUK1 530 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 CYP2C8P10632 490 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 SHMT1P34896 483 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 PDE1AP54750 535 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 FSD1Q9BTV5 496 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 CPA4Q9UI42 421 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-211ENST00000531385 M0R2C6 588 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 GH2P01242 217 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ASNSP08243 561 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 HMGCS2P54868 508 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 SP3Q02447 781 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 TREML2Q5T2D2 321 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 APPBP2Q92624 585 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM17Q9Y577 477 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 TLR2O60603 784 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 GABPAQ06546 454 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 STAP2Q9UGK3 403 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 MYH8P13535 1937 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 MTMR2Q13614 643 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ERO1AQ96HE7 468 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L12C9JPN9 530 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L21D6R901 530 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 GPAA1O43292 621 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 NUCB1Q02818 461 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 C17orf99Q6UX52 265 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 WDR18Q9BV38 432 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 CENPFP49454 3210 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-211ENST00000531385 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 GUCY1A2P33402 732 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 C12orf60Q5U649 245 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 CTR9Q6PD62 1173 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 EFCC1Q9HA90 598 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 CTGFP29279 349 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 BACE1P56817 501 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 SEPT2Q15019 361 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 ACER1Q8TDN7 264 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 GINM1Q9NU53 330 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 USP17L10C9JJH3 530 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 BCRP11274 1271 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 AKR1B1P15121 316 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 CDK8P49336 464 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 EVI5LQ96CN4 794 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 FEZ1Q99689 392 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 CABP5Q9NP86 173 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 APPP05067 770 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 PDE4AP27815 886 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 TDO2P48775 406 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 RILPL2Q969X0 211 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 FAM227BQ96M60 508 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 SWAP70Q9UH65 585 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-211ENST00000531385 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.46■■□□□ 1.19
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