RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 CYP21A2P08686 494 aa22.17■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 ECE1P42892 770 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.16■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 KRT23Q9C075 422 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF3Q9H094 633 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 SMIM22K7EJ46 135 aa22.14■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 ESR2Q92731 530 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRK-218ENST00000525459 ELP3Q9H9T3 547 aa22.14■■□□□ 1.14
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PTPRK-218ENST00000525459 TOMM22Q9NS69 142 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 USP17L5A8MUK1 530 aa22.13■■□□□ 1.13
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PTPRK-218ENST00000525459 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 CXCL11O14625 94 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTPRK-218ENST00000525459 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRK-218ENST00000525459 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRK-218ENST00000525459 JAG1P78504 1218 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRK-218ENST00000525459 SEPT2Q15019 361 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRK-218ENST00000525459 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.08■■□□□ 1.12
PTPRK-218ENST00000525459 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.08■■□□□ 1.12
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