RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.98■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.98■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 TBC1D12O60347 775 aa25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 GGA3Q9NZ52 723 aa25.97■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 WTAPQ15007 396 aa25.96■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.96■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.96■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.96■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 TMX3Q96JJ7 454 aa25.96■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
ACER3-202ENST00000525194 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SHMT1P34896 483 aa25.95■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 EVCP57679 992 aa25.95■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.95■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 TNKSO95271 1327 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SIPA1L1O43166 1804 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 CCDC69A6NI79 296 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 LY9Q9HBG7 655 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 MYH8P13535 1937 aa25.94■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 DGKHQ86XP1 1220 aa25.93■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.93■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 MAP3K10Q02779 954 aa25.92■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 APOBRQ0VD83 1088 aa25.92■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SULF1Q8IWU6 871 aa25.92■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 TEPSINQ96N21 525 aa25.92■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 DNAJC18Q9H819 358 aa25.92■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SEC23AQ15436 765 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 ME3Q16798 604 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 DCAF15Q66K64 600 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 ANKS1AQ92625 1134 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.91■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 CUL4AQ13619 759 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 CABP5Q9NP86 173 aa25.9■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 AKR1B1P15121 316 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 SLC4A3P48751 1232 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 RCAN1P53805 252 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.89■■□□□ 1.74
ACER3-202ENST00000525194 FAM196BA6NMK8 535 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 POTECB2RU33 542 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 PFKFB2O60825 505 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 ZBTB43O43298 467 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CALM1P0DP23 149 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CALM2P0DP24 149 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CALM3P0DP25 149 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 APOA5Q6Q788 366 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 KAT14Q9H8E8 782 aa25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 NMT2O60551 498 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 PPP2R5BQ15173 497 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 GTF3C6Q969F1 213 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 GINM1Q9NU53 330 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 STX8Q9UNK0 236 aa25.86■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.85■■□□□ 1.73
ACER3-202ENST00000525194 LARGE1O95461 756 aa25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms